☰

2つのファイルの列名の比較

tag-icon • tag-icon text-processing columns file-comparison
2つのファイルの列名の比較

私の最初のファイルには1099個の列があります。

#rnaseq/SNPID   hg19Location    Gene    TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW- 
rnaseq  -       ?|100133144     7.8666  9.6884  22.3240 1.8760  2.0161  7.8383  5.3991  0.0857  4.5513  15.4363     15.0035 4.3578  0.6809  2.5364  12.4086 11.5839

比較したい列は3列から始まります。

TCGA-BH-A0C0-01A        TCGA-A2-A3XY-01A        TCGA-XX-A89A-01A   TCGA-B6-A0I2-01A TCGA-LL-A6FP-01A        TCGA-EW-

2番目のファイルには1119個の列があります。

 [1]#SNPID  hg19Location    Gene    AlleleA AlleleB dbSNP   nSample TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A- 
[2]SNP_A-1780270   chr7:78599583:- MAGI2|ENSG00000187391.13        C       G      rs987435 2236    1_0.002700      1_0.006000      1_0.000300

比較したい列は8列から始まります。

TCGA-AC-A3TN-01A-11D-A227-01    TCGA-V7-A7HQ-01A-11D-A33D-01    TCGA-BH-A18R-01A-

このように、最初のファイルの列名を2番目のファイルの列名と一致させ、2番目のファイルだけが最初のファイルと同じ列名を持つようにしたいと思います。

だから、基本的に両方のファイルで同じ列名を持ちたいと思います。

答え1

1つのファイルにのみこれを行いますか？また、列はタブやカンマなどの標準で区切られていますか？これが真であれば、最も簡単な方法はLibreOffice Calcでファイルを開き、区切り文字を何か（タブなど）に設定してから、あるファイルから別のファイルに必要な列をコピーすることです。 LibreOfficeでファイルを開くときに区切り文字を設定するように求められない場合は、ファイル名を.csvfirstに変更してください。

関連情報