タンパク質が必要なヒットが0個見つかったテキストファイルがあります。私はLinux Suseを使用しています。 awkまたはsedを使用するすべてのコマンドを使用することをお勧めします。
# BLASTP 2.2.31+
# Query: ABO10498.2 DNA replication initiator protein [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# Fields: query id, subject id, evalue, % identity, % query coverage per subject
# 1 hits found
# BLASTP 2.2.31+
# Query: ABO10538.2 hypothetical protein A1S_0043 [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# 0 hits found
# Query: ABO10591.2 putative acetyl-coA synthetase/AMP-(fatty) acid ligase [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# Fields: query id, subject id, evalue, % identity, % query coverage per subject
# 23 hits found
# BLASTP 2.2.31+
# Query: ABO10598.2 eR transcriptional regulator [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# 0 hits found
希望の出力：
# BLASTP 2.2.31+
# Query: ABO10538.2 hypothetical protein A1S_0043 [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# 0 hits found
# BLASTP 2.2.31+
# Query: ABO10598.2 eR transcriptional regulator [Acinetobacter baumannii ATCC 17978]
# Database: uniprot-reviewed%3Ayes+AND+proteome%3Aup000005640.fasta
# 0 hits found
答え1
パターンが同じままであれば、次のものを使用できます。
grep -B 3 '# 0 hits found'
# 0 hits foundこれにより、一致の前に3行を含むすべての行が印刷されます。
さまざまな視聴回数は連続した線で区切られます--。したがって、| grep -v '^--'コマンドに追加することもできます。