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入力ファイル

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入力ファイル

処理するファイルが多すぎますが、必要なファイルを正確に取得できません。ファイルで何が起こるのか事前に知ることができないことに注意してください。

以下は私の入力ファイル（タブ区切り）です。ここで $1 は行番号です。破損した一連の数字が$ 3に表示されます。

797  47 M797    1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
798  47 M798    1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
799  47 M799    1     365.0     0.70     0.70 A 0.404
800  47 M800    1     365.0     0.00     0.00 A 0.990
801  47 M802    1     365.0     0.29     0.29 A 0.591
802  47 M803    1     365.0     0.12     0.12 A 0.726

これが私が望むものです：

797  47 M797    1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
798  47 M798    1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
799  47 M799    1     365.0     0.70     0.70 A 0.404
800  47 M800    1     365.0     0.00     0.00 A 0.990
801  
802  47 M802    1     365.0     0.29     0.29 A 0.591
803  47 M803    1     365.0     0.12     0.12 A 0.726

これまでに書いたコードは次のとおりです（ファイル名はtest.sh）。

awk '
   marker=substr($3,2,6)
   { if (FNR < marker) {printf "\n"}
    }' ${1}

これはこれまでに得た結果です。

797       47 M797   1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
798       47 M798   1     365.0     0.05     0.05 A 0.825
799       47 M799   1     365.0     0.70     0.70 A 0.404
800       47 M800   1     365.0     0.00     0.00 A 0.990
801       47 M802   1     365.0     0.29     0.29 A 0.591

802       47 M803    1    365.0     0.12     0.12 A 0.726

803       47 M804    1    365.0     0.08     0.08 A 0.777

これに対するより良い解決策がある人がいる場合は、教えてください。

答え1

awkPythonが役に立つことを願ってタグを付けました。

パスワード：

# !/usr/bin/python
import sys

def print_fixed_sequence(filename, line_num=0):
    with open(filename, 'rU') as f:
        for line in (x.strip() for x in f):
            _, f1, f2, data = line.split('\t', 3)
            rec_num = int(f2[1:])
            while line_num != rec_num:
                print(line_num)
                line_num += 1
            print('\t'.join((str(line_num), f1, f2, data)))
            line_num += 1

print_fixed_sequence(sys.argv[1], line_num=795)

結果：

795
796
797 47  M797    1   365.0   0.05    0.05    A   0.825
798 47  M798    1   365.0   0.05    0.05    A   0.825
799 47  M799    1   365.0   0.70    0.70    A   0.404
800 47  M800    1   365.0   0.00    0.00    A   0.990
801
802 47  M802    1   365.0   0.29    0.29    A   0.591
803 47  M803    1   365.0   0.12    0.12    A   0.726

答え2

入力ファイル

797     47      M797    1       365.0   0.05    0.05    A       0.825
798     47      M798    1       365.0   0.05    0.05    A       0.825
799     47      M799    1       365.0   0.70    0.70    A       0.404
800     47      M800    1       365.0   0.00    0.00    A       0.990
801     47      M802    1       365.0   0.29    0.29    A       0.591
802     47      M804    1       365.0   0.12    0.12    A       0.726
803     47      M807    1       365.0   0.12    0.12    A       0.726
804     47      M808    1       365.0   0.12    0.12    A       0.726
805     47      M812    1       365.0   0.12    0.12    A       0.726
806     47      M813    1       365.0   0.12    0.12    A       0.726

パスワード

#!/usr/bin/awk -f
BEGIN{ al=790               # added lines at start
       ap=0                 # appended lines (missing)
     }
{
    lc=$1                # line counter
    $1=lc+ap             # adjust line number
    mr=substr($3,2,6)    # marker
    while( NR+al+ap < lc ){ print "added ++" ++al, ap,"lc=" lc}
    while( NR+al+ap < mr ){ print $1; $1=lc+(++ap); }
    if   ( lc+ap   == mr ){ print }
    if   ( lc+ap    > mr ){ print "errorerror"; exit}
}

出力

added ++791 0 lc=797
added ++792 0 lc=797
added ++793 0 lc=797
added ++794 0 lc=797
added ++795 0 lc=797
added ++796 0 lc=797
797 47 M797 1 365.0 0.05 0.05 A 0.825
798 47 M798 1 365.0 0.05 0.05 A 0.825
799 47 M799 1 365.0 0.70 0.70 A 0.404
800 47 M800 1 365.0 0.00 0.00 A 0.990
801
802 47 M802 1 365.0 0.29 0.29 A 0.591
803
804 47 M804 1 365.0 0.12 0.12 A 0.726
805
806
807 47 M807 1 365.0 0.12 0.12 A 0.726
808 47 M808 1 365.0 0.12 0.12 A 0.726
809
810
811
812 47 M812 1 365.0 0.12 0.12 A 0.726
813 47 M813 1 365.0 0.12 0.12 A 0.726

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