以下を使用してクラスタ()から起動しますRstudio
。FastX
Rivanna
CentOS Linux release 7.3.1611 (Core)
https://arcs.virginia.edu/rivanna
これの主な目的は、計算速度とメモリ制限を大幅に増やすことです。しかし、計算を開始すると、ローカルコンピュータよりも非常に遅く、さらに遅くなります。また、メモリ制限が非常に低く、問題が発生しました。
> sce <- newSCESet(countData=UMI_count)
Error in asMethod(object) :
Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c
Rstudioで使用できるコア数とメモリ数を増やすには、いくつかの追加設定を指定する必要があるようです。どうすればいいですか?