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フォルダを繰り返してPythonスクリプトを実行するBashコマンド

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フォルダを繰り返してPythonスクリプトを実行するBashコマンド

Pythonスクリプトを実行するためにlinuxコマンドを実行しようとしています。

for f in /mnt/data/service/fmriprep/geht/sub-P*; do (python 2_correlation.py -i 
"$f" -o /mnt/data/service/corr_graph/correlation_P*.csv )

私のPythonスクリプトは、-iディレクトリの入力ファイルを-oa new .csvとして返します。各フォルダP *（P001、P002、P *）のCorrelation_P *をこのパス（/mnt/data/service/corr_graph/correlation_P *.csvに同じP001、P002、P *があります）として返したいのですが、中断されました。 。

答え1

ループが繰り返されるたびに、「P」の後の数字を抽出してcsvファイル名に使用する必要があります。

in_dir=/mnt/data/service/fmriprep/geht
out_dir=/mnt/data/service/corr_graph

for dir in "$in_dir"/sub-P*; do 
    num=${dir##*P}
    python 2_correlation.py -i "$dir" -o "$out_dir/correlation_P${num}.csv"
done

答え2

@glenn jackman ありがとうございます。私の実力が向上しました。だから私に役立つコマンドは次のとおりです。

for dir in /mnt/data/service/fmriprep/geht/sub-P*; do if [ -d "$dir" ]; then  
num=${dir##*P} && python 2_correlation.py -i "$dir" -o 
"/mnt/data/service/corr_graph/correlation_P${num}.csv";fi done

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