列2(または列5)で文字列を含む行を見つけて、列2の値を列5の値に置き換える必要がfile 1
あります。hdu
HX*
file 2
file 1
ファイル1:
64 ha 1 LIG H64 64 0.000000 12.0100 c 0.637086 12.0100
65 du 1 LIG XX65 65 0.000000 16.0000 o -0.547014 16.0000
66 du 1 LIG XX66 66 0.000000 16.0000 oh -0.611114 16.0000
67 hdu 1 LIG HX67 67 0.000000 1.0080 hc 0.090186 1.0080
68 hdu 1 LIG HX68 68 0.000000 1.0080 hc 0.090186 1.0080
ファイル2:
1LIG H64 64 2.06144000 1.94117000 2.65125000
1LIG XX65 65 2.14737000 1.92392000 2.73722000
1LIG XX66 66 1.98154000 2.05095000 2.64407000
1LIG XX67 67 2.21440000 1.72650000 2.55862000
1LIG XX68 68 2.22046000 1.85502000 2.43909000
指定された場合は交換する必要があり、XX67
出力は次のとおりです。HX67
XX68
HX68
1LIG H64 64 2.06144000 1.94117000 2.65125000
1LIG XX65 65 2.14737000 1.92392000 2.73722000
1LIG XX66 66 1.98154000 2.05095000 2.64407000
1LIG HX67 67 2.21440000 1.72650000 2.55862000
1LIG HX68 68 2.22046000 1.85502000 2.43909000
私の最高の推測はコマンドです
awk 'FNR==NR && $2=="hdu" {x=$1;y=$5} NR!=FNR { if ($3==x) {$2=y} print}' file1 file2
ただし、これは最後の発生のみを置き換えます。
答え1
これはx
、合計y
値が上書きされ、file1の最後の行だけが残るためです。 1行のコードを少し変更して配列を試してみてください。
awk 'FNR==NR && $2=="hdu" {y[$1] = $5} NR!=FNR { if ($3 in y) {$2 = y[$3]} print} ' file1 file2