ログイン後の環境変数のグローバル値の設定

はい、可能です。ただし、以前に実行した実行ファイルは新しい値を取得しません。

ちょうど使用:

export TMOUT=100
export FOO=bar

テキストセッション（putty / ssh）にある場合は問題がない可能性がありますが、GUIセッションにある場合、設定されている変数がGUIプログラムで使用されていると問題が発生する可能性があります。