リモートサーバーで次のスクリプトを実行しています。
awk '{sub(/.nc$/, ""); print}' Time012010star.txt > Star.txt #remove .nc
awk '{sub(/.nc$/, ".nc.gz"); print}' Time012010star.txt > StarGZ.txt # add .gz
TempsModel=$(wc -l < TempsModel.txt) #"$(ls -lq *_??????.nc | wc -l)"
outputNumber=$(wc -l < Time012010star.txt)
UarrI1=$(sed -n $index'p' uI1.txt)
UarrI2=$(sed -n $index'p' uI2.txt)
UarrJ1=$(sed -n $index'p' uJ1.txt)
UarrJ2=$(sed -n $index'p' uJ2.txt)
VarrI1=$(sed -n $index'p' vI1.txt)
VarrI2=$(sed -n $index'p' vI2.txt)
VarrJ1=$(sed -n $index'p' vJ1.txt)
VarrJ2=$(sed -n $index'p' vJ2.txt)
TarrI1=$(sed -n $index'p' tI1.txt)
TarrI2=$(sed -n $index'p' tI2.txt)
TarrJ1=$(sed -n $index'p' tJ1.txt)
TarrJ2=$(sed -n $index'p' tJ2.txt)
# from all the netcdf files extract the vel_u (and eventually vel_v) with the indices that are in *I1.txt and *J1.txt
for ((index=1; index<=$outputNumber; index++)) #size de I.txt
do
TimeNC=$(sed -n $index'p' Time012010star.txt) #TempsModel.txt
Time=$(sed -n $index'p' Star.txt)
TimeGZ=$(sed -n $index'p' StarGZ.txt)
scp -r /home/elisev/QUANTUM/Jan2010/${TimeGZ} /home/elisev/ScriptsLinux/SOLA/Scripts/${TimeGZ} #copy remote file locally
gunzip /home/elisev/ScriptsLinux/SOLA/Scripts/${TimeGZ}
ncrcat -C -F -d nj_u,$UarrJ1,$UarrJ2 -d ni_u,$UarrI1,$UarrI2 -v vel_u /${TimeNC} u${Time}.nc
ncrcat -C -F -d nj_v,$VarrJ1,$VarrJ2 -d ni_v,$VarrI1,$VarrI2 -v vel_v /${TimeNC} v${Time}.nc
ncrcat -C -F -d nj_w,$TarrJ1,$TarrJ2 -d ni_w,$TarrI1,$TarrI2 -v w /${TimeNC} w${Time}.nc
ncrcat -C -F -d nj_t,$TarrJ1,$TarrJ2 -d ni_t,$TarrI1,$TarrI2 -v sal /${TimeNC} sal${Time}.nc
ncrcat -C -F -d nj_t,$TarrJ1,$TarrJ2 -d ni_t,$TarrI1,$TarrI2 -v tem /${TimeNC} tem${Time}.nc
echo "${Time}"
rm /home/elisev/ScriptsLinux/SOLA/Scripts/${TimeNC}
done
echo "Loop is done"
最初のファイルを正しくコピーしましたが、次のエラーが発生しました。
ncrcat: WARNING not searching for /20100101_0020*.nc on remote filesystem, using local file 0100101_0020*.nc instead
ncrcat: WARNING not searching for /20100101_0020*.nc on remote filesystem, using local file 0100101_0020*.nc instead
ncrcat: WARNING not searching for /20100101_0020*.nc on remote filesystem, using local file 0100101_0020*.nc instead
ncrcat: WARNING not searching for /20100101_0020*.nc on remote filesystem, using local file 0100101_0020*.nc instead
ncrcat: WARNING not searching for /20100101_0020*.nc on remote filesystem, using local file 0100101_0020*.nc instead
ファイルを生成しますが、0100101_0020*.ncというファイルがないようで、何がわかりません。この問題をどのように解決できますか?
答え1
解決策が見つかりました。明らかに、すべてのフォルダがある同じディレクトリでスクリプトを実行しても、フォルダパスを明示的に知らせる必要があるため、次の行は次のようになります。
ncrcat -C -F -d nj_u,$UarrJ1,$UarrJ2 -d ni_u,$UarrI1,$UarrI2 -v vel_u /${TimeNC} u${Time}.nc
する必要があります
crcat -C -F -d nj_u,$UarrJ1,$UarrJ2 -d ni_u,$UarrI1,$UarrI2 -v vel_u path/to/file/${TimeNC} u${Time}.nc