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UbuntuでTrimmomamaticを実行できません

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UbuntuでTrimmomamaticを実行できません 
mohammad@abbasi ~/NGS/Data/RESULTS/TR
$ java -jar ~/NGS/programs/Trimmomatic-0.39/trimmomatic-0.39.jar PE DRR000001_1.fastq DRR000001_2.fastq -baseout GgG.fastq HEADCROP:15 LEADING:30 TRAILING:30 MINLEN:50; done
-bash: syntax error near unexpected token `done'
(base)

答え1

あなたの行はループ（、、、）を終了するためのシェル構文; doneで終わりますが、ループを開始しません。シェルはどのループを終了するのかわからないので、到着時に混乱します。doneforwhileuntildone

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