答え1
彼らは非常に異なる獣です。
Ntopは、インターフェイス上のパケットレベルのネットワークトラフィックを監視するように設計されています。 ntopを実行してパケットを処理できるホストからのみ情報を収集できます。
一方、MRTGはさまざまなソース（通常はSNMP経由）と多数のデバイス（ほとんどのデバイスがSNMPをサポートしているため）から情報を収集します。ただし、利用可能な情報の種類は、詳細なパケット解析よりも厳密ではありません。
したがって、両方を試してみて、どちらが必要な情報を提供しているかを判断する必要があります。どちらも好きなら、両方使ってみてください！