私はbashに初めてアクセスし、次のようにマージしたいテキスト(.txt)ファイルのリストがあります。
1.unmapped.F.fq
1.unmapped.R.fq
1.unmapped.s.fq
2.unmapped.F.fq
2.unmapped.R.fq
2.unmapped.s.fq
F / R / sファイルをマージして次のような出力を生成したいと思います。
1.unmapped.all.fq
2.unmapped.all.fq
同様のアプローチを使用して、Rでより単純な名前のファイルをマージしました。
for(i in 1:10){
data <- paste0("A.",i)
assign(paste0("data",i), read.csv(data))
}
しかし、入力が変化し続ける2つの場所(1/2とF / R / s)があるか、ループが最善の方法なので、bashでこれを行う方法がわかりません。
答え1
私が正しく理解したら、次のことを試してください。
for i in {1..2}; do # 1 to 2 just to match with the sample posted
cat "$i".unmapped.{F,R,s}.fq >> "$i".unmapped.all.fq
done