☰

awkを使用して複数の列をコロンにリンクする方法は？

tag-icon • tag-icon text-processing awk
awkを使用して複数の列をコロンにリンクする方法は？

次のファイルがあります。

head 1kG_MDS6.bim
1   rs2073813   0   753541  A   G
1   rs60320384  0   769223  G   C
1   rs59066358  0   771967  A   G
...

「：」で区切られた最初、4番目、6番目、5番目の列を順番に連結したいと思います。

したがって、出力は次のようになります。

1:753541:G:A
1:769223:C:G
1:771967:G:A

私はこれを試しました：

awk ' { print $1 $4 $6 $5 ":" $NF } ' 1kG_MDS6.bim > 1kG_MDS6_SNPs1.txt

しかし、最後の2つの列":"とのみ結合されます。

答え1

出力フィールド区切り文字を使用します。

awk 'BEGIN{OFS=":"} {print $1,$4,$6,$5}' file

出力：

1:753541:G:A
1:769223:C:G
1:771967:G:A

答え2

printfを使う

awk ' { printf "%s:%s:%s:%s\n",$1,$4,$6,$5; } '

どこ

  • %s 一致するパラメータを文字列に置き換えます。
  • \n 処理された各行に改行文字が追加されます。

関連情報