ファイル1の列7、8、9をファイル2の列7、8、9にコピーして新しいファイル3を作成しました。生成されたファイル（ファイル3）が元のファイルと整列していません。並べ替えを維持するにはどうすればよいですか？
私は次のコマンドを使用しました。
awk '(getline line < "file 1") > -1 {split(line,a); $7 = a[7]; $8 = a[8]; $9= a[9]} 1' file 2 > file 3
ファイル1：
GRM in vacuum
192700
1GRM C1 1 17.188 0.311 13.994 -0.5971 0.0204 -0.0724
1GRM C2 2 0.094 0.383 0.005 0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM C3 3 0.091 0.524 0.008 -0.7098 0.3449 -0.3952
ファイル2：
GRM in vacuum
192760
1GRM C1 1 0.061 0.071 14.000
1GRM C2 2 0.184 0.142 14.000
1GRM C3 3 0.184 0.284 0.000
ファイル3（出力）：
GRM in vacuum
192760
1GRM C1 1 0.061 0.071 14.000 -0.5971 0.0204 -0.0724
1GRM C2 2 0.184 0.142 14.000 0.4831 -0.8709 -0.2204
1GRM C3 3 0.184 0.284 0.000 -0.7098 0.3449 -0.3952
並べ替えの問題を解決するには、次のものを使用しました。
awk 'BEGIN{fmt="%10s%9s%7d%8.3f%8.3f%8.3f%8.4f%8.4f%8.4f"} (getline line < "file 1") > -1 {n = split(line,a)} n > 6 {$0 = sprintf(fmt,$1,$2,$3,$4,$5,$6,a[7],a[8],a[9])} 1' "file 2" > file 3
しかし、まだ2つの質問があります。
最初の問題は、出力ファイルの列が元のファイル（ファイル1およびファイル2）とは異なるようにソートされていることです。
第２の問題は、ライン１０００２で発生する。列 2 と 3 が一緒にマージされ、ライン 10002 から最後までの列全体が出力ファイルから消えます。以下は、10002行の3つのファイルです。
ファイル1：
2500GRM C3 9999 15.716 8.242 0.002 0.2372 -0.2989 -0.0758 # line 10001
2500GRM C410000 15.592 8.311 0.003 0.2603 -0.2492 -0.2394 # line 10002
2501GRM C110001 15.591 8.453 0.006 0.0887 -0.2458 -0.7014 # line 10003
2501GRM C210002 15.714 8.524 0.007 -0.0788 0.0598 -0.9619 # line 10004
ファイル2：
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 # line 10001
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 # line 10002
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 # line 10003
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 # line 10004
ファイル3：
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 0.2372 -0.2989 -0.0758 # line 10001
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 -0.2492 -0.2394 # line 10002
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 -0.2458 -0.7014 # line 10003
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 0.0598 -0.9619 # line 10004
次のリンクにすべてのファイルを添付しました。
https://drive.google.com/drive/folders/13diMVxlp-T9BXE_jnm_LL1jUPbz8eren
答え1
問題は、8〜9個のデータフィールドがあり、file15〜6個のデータフィールドがあることですfile2。C3 9999
型が無効なフィールドであるか、2つのフィールドの合計でC410000なければなりません。C410000
フィールド数に基づいて書式を調整するには、次の手順を実行します。
- 2 つの書式文字列の使用と 2 つの切り替え
n行を分割して最後の3つの値を取得するときに、配列要素の数を保存しますa[n-2]。a[n-1]a[n]
awk '
BEGIN{
fmt1="%8s %6s%5s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
fmt2="%8s %11s %7.3f %7.3f %7.3f %7.4f %7.4f %7.4f" ORS
}
(getline line < "file 1") > -1{
n=split(line, a)
}
NF<=3{ print; next } # print original line
NF==6{ printf fmt1, $1, $2, $3, $4, $5, $6, a[n-2], a[n-1], a[n]; next } # 6 + 3 fields
{ printf fmt2, $1, $2, $3, $4, $5, a[n-2], a[n-1], a[n] } # 5 + 3 fields
' "file 2" > "file 3"
出力：
...
2500GRM C3 9999 15.433 8.378 0.000 0.2372 -0.2989 -0.0758
2500GRM C410000 15.310 8.449 0.000 0.2603 -0.2492 -0.2394
2501GRM C110001 15.310 8.591 0.000 0.0887 -0.2458 -0.7014
2501GRM C210002 15.433 8.662 0.000 -0.0788 0.0598 -0.9619
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