次のように、毎月のフォルダごとに並べ替えられた衛星データを含むデータセットのリストがあります。
01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12
これらのフォルダは、毎日のデータフォルダに分けられます。たとえば、最初の月の場合、01
日次ファイルは次のようにフォルダーにソートされます。
01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31
最後に、データセットがあります。
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0059-o60970_v003-2016m0107t153711.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1410-o60978_v003-2016m0107t153715.he5
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0237-o60971_v003-2016m0107t153714.he5 OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1410-o60978_v003-2016m0107t153715.he5.met
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0237-o60971_v003-2016m0107t153714.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1549-o60979_v003-2016m0107t153713.he5
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0416-o60972_v003-2016m0107t153715.he5 OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1549-o60979_v003-2016m0107t153713.he5.met
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0416-o60972_v003-2016m0107t153715.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1727-o60980_v003-2016m0107t153718.he5
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0555-o60973_v003-2016m0107t153709.he5 OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1727-o60980_v003-2016m0107t153718.he5.met
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0555-o60973_v003-2016m0107t153709.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1906-o60981_v003-2016m0107t153716.he5
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0734-o60974_v003-2016m0107t153717.he5 OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t1906-o60981_v003-2016m0107t153716.he5.met
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0734-o60974_v003-2016m0107t153717.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t2045-o60982_v003-2016m0107t153719.he5
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0913-o60975_v003-2016m0107t153711.he5 OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t2045-o60982_v003-2016m0107t153719.he5.met
OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t0913-o60975_v003-2016m0107t153711.he5.met OMI-Aura_L2-PROFOZ_2016m0101t2224-o60983_v003-2016m0107t153717.he5
.he5
拡張子を持つファイルを抽出し、ファイル名を保持する次のコードを使用してnetcdfファイルに変換したいと思います。
ncks inputfile.he5 inputfile.nc
各ファイルを処理しようとしてシェルスクリプトを作成しました。
shopt -s globstar
for f in ./**; do
echo "$f" |grep -v .met | grep ".he5"
echo "$f" |grep -v .met |ncks $(grep".he5") $(echo $(grep -o 'OMI-Aura_L2-PROFOZ_[0-9]\{4\}m[0-9]\{4\}t[0-9]\{4\}-o[0-9]\{5\}_v003-[0-9]\{4\}m[0-9]\{4\}t[0-9]\{6\}').nc)
done
ファイル名を抽出できますが、出力を取得できません。最終的にすべてのファイルをどのように変換できますか?
答え1
コマンドが複雑すぎるため、同様のコマンドは必要ありませんgrep
。
shopt -s globstar
for f in ./**/*.he5; do
ncks "$f" "${f%.*}.nc"
done
${f%.*}
最後の文字から始まるすべての文字を削除します。.
答え2
find
findとそのオプションを使用すると、findはexecdir
ディレクトリをファイルが見つかったディレクトリに変更し、ファイルの親ディレクトリから次のようにコマンドを実行できます。
find /path/to/source/directory -type f -name '*.he5' -execdir sh -c '
for file; do
ncks "${file}" ${file%.he5}.nc"
done
' sh_ncks {} +
構文は次のとおり${parameter%word}
です。パラメータ拡張、引数から最短のサフィックスを削除します。