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ArchlinuxへのDESeq2のインストール

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ArchlinuxへのDESeq2のインストール

おすすめを実行してみましたインストールに関する注意:

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("DESeq2")

長い間印刷した後、このメッセージを確認しました。

Warning messages:
1: In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘genefilter’ had non-zero exit status
2: In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘DESeq2’ had non-zero exit status

Ubuntuでもこの問題を発見しましたが、安定して解決されました。この回答。ただし、libcurl-opensslArchにパッケージをインストールすることはできません。

ArchlinuxにDESeq2をインストールする方法は？

答え1

これが今どのくらい役に立つのかわかりませんが、R Studioシステムに問題がある可能性がありますgcc-fortran。以下を実行してみてください。

sudo pacman -S gcc-fortran

同じ問題が発生したとき、これは私にとって効果的でした。

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