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ある列の正の値と負の値を別の列の値に分割し、結果を新しい列に追加する方法[閉じる]

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ある列の正の値と負の値を別の列の値に分割し、結果を新しい列に追加する方法[閉じる]

大きなテキストファイルがありますが、7列（BETA）から8列（SE）までの値を分割し、結果（11列）を含むテーブルの末尾に新しい列を作成したいと思います。問題は、7列の値の一部が0を超えて負数であることです。

SNP         CHR BP         A1 AX A1_FREQ BETA        SE         P          OBS_CT
rs10875231  1   100000012  T  G  0.405   -0.0456807  0.02260471 0.04335677 4400
rs6678176   1   100000827  C  T  0.383   0.02553138  0.02287662 0.2645817  4400
rs78590530  1   100000948  A  G  0.016   0.171376    0.08757958 0.05035017 4400
rs149636485 1   100001060  A  G  0.004   -0.03363731 0.1819208  0.8529224  4400
rs116216467 1   100001233  C  T  0.043   -0.06690947 0.05683414 0.238941   4400

答え1

数字以外の文字列を含む最初の行が原因でエラーが発生します。次のように除外できます。

NR!=1 { $11 = $7/$8 }
1

これで、列8にゼロがある可能性があると思われる場合は、$ 8がゼロでないことを確認する必要があります。パターンに条件を追加できます。

NR!=1 && $8!=0 { $11 = $7/$8 }
1

または、if以下を追加してください。

{ if (NR!=1 && $8!=0) $11 = $7/$8; print }

負の値がなぜ問題なのかわかりません。

答え2

awk 'BEGIN{print "SNP         CHR BP         A1 AX A1_FREQ BETA        SE         P          OBS_CT"}NR>1{$11=$7-$8;print $0}' filename


output

SNP         CHR BP         A1 AX A1_FREQ BETA        SE         P          OBS_CT
rs10875231 1 100000012 T G 0.405 -0.0456807 0.02260471 0.04335677 4400 -0.0682854
rs6678176 1 100000827 C T 0.383 0.02553138 0.02287662 0.2645817 4400 0.00265476
rs78590530 1 100000948 A G 0.016 0.171376 0.08757958 0.05035017 4400 0.0837964
rs149636485 1 100001060 A G 0.004 -0.03363731 0.1819208 0.8529224 4400 -0.215558
rs116216467 1 100001233 C T 0.043 -0.06690947 0.05683414 0.238941 4400 -0.123744

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