質問
ansibleを使用して仮想ボックスを構成したいと思います。このボックスには多くのことが行われていますが、Rをインストールする必要があり、基本Rに含まれていない特定のパッケージが必要です。
以下に示す vagrant ファイルを使用して新しい仮想マシンを作成し、yum を使用して ansible、epel-release、および git をインストールしました。次に、その仮想マシンで以下に提供されている「Alma Linux 8」および「Docker」プレイブックを使用しますが、問題があると思われるプレイブックがあります。
その後、このプレイブックを実行してRをインストールしました。
---
- name: "Setup R on the local machine"
hosts: localhost
connection: local
tasks:
# Update all installed packages
- name: Update all packages to their latest version
become: yes
ansible.builtin.package:
name: "*"
state: latest
# Install EPEL to get extra packages
- name: Install EPEL
become: yes
ansible.builtin.package:
name: epel-release
state: latest
# Enable the Code Ready Builder (CRB) repository
- name: Install utilities to enable package repositories
become: yes
ansible.builtin.package:
name: yum-utils
state: latest
- name: Enable the PowerTools repository
become: yes
shell: dnf config-manager --set-enabled powertools
# Install R
- name: Install R
become: yes
ansible.builtin.package:
name: R
state: latest
このプレイブックを実行した後、次のコマンドを実行できます。
Rscript --slave --no-save --no-restore-history -e "print('Test')"
[1] "Test"
Rが少なくともある程度動作していることを示します。ただし、これを使用してパッケージをインストールしようとすると、次のエラーが発生します。
Rscript --slave --no-save --no-restore-history -e "install.packages('tidyverse')"
"/usr/lib64/R/library" にパッケージのインストール ("lib" が指定されていないため) install.packages("tidyverse") の警告: "lib = "/usr/lib64/R/library"" は許可ではありません。 install.packages("tidyverse") の書き込みエラー: パッケージをインストールできません。実行が停止しました。
修正しよう
私は上記のRプレイブックの最後に次の行を追加してこの問題を解決しようとしました。
- name: Make directory writable
become: yes
file:
path: /usr/lib64/R/library
mode: '0777'
- name: Make directory writable
become: yes
file:
path: /usr/share/doc/R/html
mode: '0777'
私は問題のディレクトリを手動で読み取ることができましたが、うまくいきませんでした。
参照文書
迷子になったファイル
Vagrant.configure("2") do |config|
config.vm.box = "almalinux/8"
config.vm.provider "virtualbox" do |vb|
vb.memory = "2048"
vb.cpus = 2
end
end
アンサーブルマニュアル
アルマLinux 8
---
- name: "Setup AlmaLinux 8 on the local machine"
hosts: localhost
connection: local
tasks:
# Install the base operating systemctl
- name: Update all packages to their latest versions
become: yes
ansible.builtin.package:
name: '*'
state: latest
- name: Install virtual machine support
become: yes
ansible.builtin.package:
name: open-vm-tools
state: latest
# Install EPEL to get extra packages
- name: Install EPEL
become: yes
ansible.builtin.package:
name: epel-release
state: latest
ルーストアバウト
---
- name: "Setup Docker on the local machine"
hosts: localhost
connection: local
tasks:
# Install Docker
- name: Uninstall any older versions of Docker
become: yes
ansible.builtin.package:
name:
- docker
- docker-client
- docker-client-latest
- docker-common
- docker-latest
- docker-latest-logrotate
- docker-logrotate
- docker-engine
state: absent
- name: Install yum-utils to install a new package repository
become: yes
ansible.builtin.package:
name: yum-utils
state: latest
- name: Install the Docker Repository
become: yes
shell: yum-config-manager --add-repo https://download.docker.com/linux/centos/docker-ce.repo
- name: Install Docker
become: yes
ansible.builtin.package:
name:
- docker-ce
- docker-ce-cli
- containerd.io
- docker-buildx-plugin
- docker-compose-plugin
state: latest
- name: Enable the docker service
become: yes
shell: systemctl enable docker
- name: Enable the containerd service
become: yes
shell: systemctl enable containerd
- name: Start the docker service
become: yes
shell: systemctl start docker
- name: Start the containerd service
become: yes
shell: systemctl start containerd
- name: Ensure docker group exists
become: yes
ansible.builtin.group:
name: docker
state: present
- name: Add the vagrant user to the docker group
become: yes
ansible.builtin.user:
name: vagrant
groups: docker
append: yes
答え1
しかし、次のようにパッケージをインストールしようとすると
通常のユーザーとしてこれを実行していますが、システムディレクトリにインストールしようとするとこれが問題です。
システム全体にインストールしますか?次に、rootとしてこれを行います。そのユーザー一人にのみパッケージが必要ですか?その後、システム全体にインストールしないでください。