ファイルをzipに変換する前に、ファイルをクリーンアップしてクリーンアップするbashスクリプトを実行しています。スクリプトを実行すると、複数の Thunar 「警告」と「批判」が表示され、その意味を把握するのが困難になります(図を参照)。これはスクリプトがファイルをコピーしたときに発生します。
私が配置できない奇妙な名前のファイルのコンテンツタイプの読み込みエラーが言及されました。何がこれらの警告を生成しますか?
thunar-WARNING **: 16:45:16.720: Content type loading failed for sedVOTg4r: Error when getting information for file /path/to/file/sedVOTg4r : No such file or directory
GLib-GIO-CRITICAL **: 16:45:16.722: g_file_info_get_attribute_uint32: assertion 'G_IS_FILE_INFO (info)' failed
スクリプトは次のとおりです。
#!/bin/bash
subj=$1
outBase=$2
echo $subj
echo $outBase
subj_site_list=path/to/scripts/subj_site_list.txt
######### make/check dir structure exists ########
outStudy=${outBase}/Leapeuaims_2
if [[ ! -d "${outStudy}" ]] ; then
mkdir ${outStudy}
fi
## Set matching site collection for the particular subject
site=$(awk -v search="$subj" '{gsub(/^[ \t]+|[ \t]+$/, "");} $1 == search {print $2}' "$subj_site_list" | tr -d '\r')
echo "${subj} is a ${site} participant"
echo
if [ "$site" = "University1" ]; then
outCentre=${outStudy}/University1
elif [ "$site" = "University2" ]; then
outCentre=${outStudy}/University2
elif [ "$site" = "999" ]; then
echo ">> site code 999, skipping subject $subj"
sed --in-place "/$subj/d" ./logfile.txt
echo ">> site code 999, skipping subject $subj" >> logfile.txt
echo
exit
else
echo ">> subject $subj not listed; check for withdrawn consent"
echo
fi
echo "site parameter set to $outCentre"
echo
if [[ ! -d "${outCentre}" ]] ; then
mkdir ${outCentre}
fi
## Make BOLD folder for preprocessed data
BOLD=${outCentre}/BOLD
if [[ ! -d "${BOLD}" ]] ; then
mkdir ${BOLD}
mkdir ${BOLD}/Preprocessed
fi
####### Check what subj data exists/mk dirs and copy over/rename as needed per modality #########
indir=/path/to/subject_data/$subj/
echo "Wrapping contents ${indir}"
echo
#BOLD
if ls $indir/BOLD_data/preprocessing/* 1> /dev/null 2>&1; then
subjbold=${BOLD}/Preprocessed/${subj}
mkdir $subjbold
rsdir=${subjbold}/Resting_state
mkdir $rsdir
echo "adding preprocessed resting state data"
cp -r $indir/BOLD_data/preprocessing/* $rsdir/
echo "done"
echo
else
echo ">> no preprocessed data found for $subj"
echo
sed --in-place "/$subj/d" ./logfile.txt
echo "${subj}: no fMRI data found" >> logfile.txt
fi