私は大学の高性能コンピューティングセンターでクラスタを使用しており、作業管理にSGEシステムを使用しています。ご存知のように、デフォルトではSGEはNAME.oXXXXX
、、、および2つのファイルを出力しますNAME.poXXXXX
。この出力でシミュレーション速度が遅くなるのではないかと思います。
一般的に、シミュレーションには数週間かかり、ファイルがNAME.oXXXXX
数ギガバイトほどかなり大きくなるため、このような大きなファイルがシミュレーションを遅くするのが少し心配です。
誰でも経験がありますか?もしそうならオフにする方法。実は私するこの出力ログは私の結果を確認するために時々必要です。
PS:私が今使っているストレージはAFS、しかし傷跡だからそれは役に立たないfsync
。
ありがとうございます!
答え1
ログにどれだけ記録しているかによって異なりますが、私の考えでは、あまりにも多くのステップがすべて線なので、心配する必要はありません。ほとんどのシミュレーションは通常、途中でより多くのステップを実行します(各ステップには数千の計算があります)。 ) ログラインを作成します。
出力.oXXXX
ファイルはシミュレーションパッケージの標準出力です。それ以外の場合はコンソール(「パラレル出力」)に書き込まれるため、.poXXXX
作成頻度はプログラムによって異なります。したがって、作成する量は完全にシミュレーションパッケージによって異なります。可能であれば、出力周波数を下げる方法については、マニュアルを参照してください。それにもかかわらず、これはシミュレーション速度にほとんど影響を与えません。