ファイル移行後のCentOS 6.5権限の変更

VirtualBox 仮想マシンで CentOS 6.5 を実行しています。最近、仮想ハードドライブの空き容量がなくなりました。この問題を解決するために、このディレクトリ用の2番目のハードドライブを作成することにしました/usr。私はそれをインストールし、ファイルをrootにコピーしましたrsync -a /usr.bak /usr。これは、すべてのファイルの所有権と権限を維持しているようです。

しかし、今、奇妙な権限の問題が発生しました。システムを正常に起動できますが、次のように動作しないことがよくあります。

1. sudo service network restart「eth0のIP情報を確認する」と、ネットワークアダプタが機能しません。
2. ACPIをオフにすると、Gnomeに同じダイアログボックスが表示されなくなります。
3. 「/usr/bin/logger: 権限が拒否されました」というエラーが表示されます。

以前はSELinuxを無効にしていたので、これが邪魔になるとは思いません。また、rootとして実行して権限を変更しようとしましたが、問題は解決しません。

for i in `rpm -qa`;do rpm --setperms $i;done

rsyncこの新しいマウントポイントを使用してファイルをコピーすると、どのような問題が発生する可能性がありますか？問題を解決するために私ができることはありますか？これは開発サンドボックスなので、修正に最適ではないセキュリティ設定が含まれているかどうかは心配しません。