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awkでの解析/操作

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awkでの解析/操作

私はプログラミングが初めてですawk。テキストファイルの操作に関する質問がありますが、可視化ソフトウェア（Circos）を使用する必要があります。http://circos.ca)

その値を処理するために使用したい入力データがありますawk/grep/sed。合計9組（18ライン）があります。 5組（最初の10行）は「from = ABCB11」、4対（次の8行）は「from = ABCC8」です。最初のペアの最初の行から値を抽出し、残りのペアの各シフト行の値を変更したいと思います。したがって、グループ2の値は9 10であり、これはグループ2のすべての値を置き換える必要があります。グループ2の次の値は28 29で、9 10に置き換える必要があります。

停留所は「from = name」、つまり「from = ABCB11」として決定する必要があります。式がキャプチャされ、次の発生から置き換える必要がある行は、この例のようにグループ2に属する必要はありません。 3～4グループから10グループまで可能です。したがって、2番目のグループ（「from = ABCC8」）はグループ4/5/6に属することができますが、必ずしもグループ2に属する必要はありません。偶然の一致だけですが、"from ="代替行ごとにすべてのグループ番号が同じです。

group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-3 0 1 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-2 28 29 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM1,toid=114,use=1,z=1
group-5 0 1 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM1,toid=114,use=1,z=1
group-2 29 30 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM2,toid=115,use=1,z=1
group-5 1 2 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM2,toid=115,use=1,z=1
group-2 10 11 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=DRD2,toid=158,use=1,z=1
group-3 1 2 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=DRD2,toid=158,use=1,z=1
group-2 11 12 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=EGF,toid=164,use=1,z=1
group-3 2 3 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=EGF,toid=164,use=1,z=1
group-2 21 22 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-3 12 13 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-2 0 1 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1A,toid=21,use=1,z=1
group-1 0 1 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1A,toid=21,use=1,z=1
group-2 1 2 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1B,toid=22,use=1,z=1
group-1 1 2 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1B,toid=22,use=1,z=1
group-2 2 3 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1D,toid=23,use=1,z=1
group-1 2 3 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1D,toid=23,use=1,z=1

私が探している最終結果は次のとおりです。

group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-3 0 1 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM1,toid=114,use=1,z=1
group-5 0 1 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM1,toid=114,use=1,z=1
group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM2,toid=115,use=1,z=1
group-5 1 2 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=CHRM2,toid=115,use=1,z=1
group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=DRD2,toid=158,use=1,z=1
group-3 1 2 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=DRD2,toid=158,use=1,z=1
group-2 9 10 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=EGF,toid=164,use=1,z=1
group-3 2 3 text color=black,from=ABCB11,fromid=4,order=2,thickness=3,to=EGF,toid=164,use=1,z=1
group-2 21 22 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-3 12 13 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ACE,toid=11,use=1,z=1
group-2 21 22 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1A,toid=21,use=1,z=1
group-1 0 1 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1A,toid=21,use=1,z=1
group-2 21 22 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1B,toid=22,use=1,z=1
group-1 1 2 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1B,toid=22,use=1,z=1
group-2 21 22 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1D,toid=23,use=1,z=1
group-1 2 3 text color=black,from=ABCC8,fromid=5,order=2,thickness=3,to=ADRA1D,toid=23,use=1,z=1

また、これはサンプルデータにすぎません。多くのペアには、グループ1、グループ4、グループ5、および最大グループ10があります。ここでは、小さなグループのペアだけが言及されています。

デフォルトでは、これは各置換行の「from = ABCB11」の終わりまで行全体を印刷するときに確認する必要がある修正です。 「from=ABCC8」の場合も同様です。

group-2 9 10
group-3 0 1
group-2 9 10
group-5 0 1
group-2 9 10
.........
.........
.........

私が試したことは次のとおりです。

各置換行のすべての項目を変更できるように、「from = name」の値が同じになるまで行を繰り返したいと思います。パスワード：

awk -F, 'NR%2==1 {split($2,a,"="); print a[2]}' file.txt

上記のコードは、「from = name」から代替行と「name」を抽出できます。

答え1

次のようにしてみてください。

awk 'NR%2{if(p!=$2){v=$1; p=$2}$1=v}1' FS=, OFS=, file

$2これは変更されたかどうかをテストし、$1すべての奇数行をすべての奇数行で同じ値に置き換えます。$2

説明が追加されました。

awk '
  NR%2 {            # On every line where NR (recordnr) mod 2 equals 1 (odd line)
    if(p!=$2) {     # If the variable p (previous) is different from the 2nd field then
      v=$1          # The new value v should become $1 (1st field)
      p=$2          # The new variable p becomes the current field 2
    }               #
    $1=v            # On every odd line field 1 becomes the previously set value
  }
  1                 # 1 means true. The default action is to print the record (line)
' FS=, OFS=, file   # Set the input and output field separators to a comma.

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