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2行を2列に変換

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2行を2列に変換

を使用して2行を2列に変換したいと思いますawk。

入力.txt:

# Query: gi|11465907|ref|NC_001872.1| Chlamydomonas eugametos genome, complete genome
# 0 hits found
# Query: gi|11465922|ref|NC_000892.1| Pedinomonas minor genome, complete genome
# 1 hits found

出力.txt:

Chlamydomonas eugametos genome 0
Pedinomonas minor genome 1

答え1

入力ファイルが一貫していると仮定します。

awk -F'[|,]' '/genome/ {printf "%s ", $5; next} {print substr($1,3,1)}' input.txt > output.txt
Chlamydomonas eugametos genome 0
Pedinomonas minor genome 1

答え2

努力する：

awk -F'[|] |,' '{getline p; split(p,H," "); print $2,H[2]}' file

|これは、区切りフィールドに追加のコンマを必要としません。

この意味では、次の方が強力です。

awk -F'[|] *' '{getline p; split($5,Q,","); split(p,H," "); print Q[1],H[2]}' file

sedの代替案：

sed 'N; s/.*| *//; s/,.*\n#//; s/ hits found//' file

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