私はPythonコードを含むbashスクリプトを書いた。私がすることは、ファイルを読み込み、次のbashコマンドを使用して切り取り、次にPythonコードで使用できるようにエクスポートすることです。
export BWA_compare=$(cut --output-delimiter='' -f1-3 ${BWA_AT}| sed 1d)
問題は私が得るということです
/bin/cut: Argument list too long
/bin/sed: Argument list too long
小さなファイルにはうまくいきます。輸出できる数量に制限はありますか？
答え1
パラメーターの数とパラメーターの組み合わせの長さには制限があります。これは均一な値ではありませんが、システムによって異なります。
通常、これらの問題はで解決できますxargs。
ところが私が見るにはcut間違って使っているようです。cutパラメータにはファイルのみが必要です。${BWA_AT}ファイルリストが大きいですか？ Pythonコードの場合は、次のものが必要です。
echo "${BWA_AT}" | cut
実際にファイルリストの場合は、次のものが必要です。
echo "${BWA_AT}" | xargs cut
必要なオプションはxargs区切り文字によって異なります。