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awk コマンド情報

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awk コマンド情報

awk誰でもコマンドを使用してファイル全体に特定の単語を追加する方法を教えてもらえますか？

データは次のとおりです。

Organism: ahy   
matching miRNAs 
    miR156a
    miR156b
    miR156c
    miR159
    miR167
    miR3512
    miR3519
    miR394

Organism: aly   
matching miRNAs 
    miR156a
    miR156b
    miR156c
    miR156d
    miR156e
    miR156f
    miR156g
    miR156h
    miR157a
    miR157b
    miR157c
    miR157d
    miR159a
    miR159b
    miR159c
    miR160a
    miR160b
    miR160c
    miR161

今、出力は次のようになりたいと思います。

Organism: ahy   
matching miRNAs 
ahy miR156a
ahy miR156b
ahy miR156c
ahy miR159
ahy miR167
ahy miR3512
ahy miR3519
ahy miR394

Organism: aly   
matching miRNAs 
aly miR156a
aly miR156b
aly miR156c
aly miR156d
aly miR156e
aly miR156f
aly miR156g
aly miR156h
aly miR157a
aly miR157b
aly miR157c
aly miR157d
aly miR159a
aly miR159b
aly miR159c
aly miR160a
aly miR160b
aly miR160c
aly miR161
aly miR162a
aly miR162b
aly miR163

これを行うためにコマンドを使用する方法を提案してくださいawk。私は初心者で努力していますが、ファイル全体に特定の単語を追加する方法が見つかりませんでした。

答え1

はい、awkこのタイプの作業に適したツールです。質問のように、すべてのデータが1つのファイルにあるとし、次のことを試してください。

awk '
  /^Organism:/  { prefix = $2 ; print ; next }
  /^matching/ || !NF  { print ; next }
  { print prefix, $1 }
'

答え2

私の考えでは、を使用する方が良いと思いますsed。例えば:sed 's/\ / ahy /g'およびsed 's/\ / aly /g'。ahyまたは空白文字を置き換えますaly。

また、可能ですawkが、データがどのように保存されるのか理解できません：-/

編集する：

この試み awk '{if ($1=="Organism:") {word = $2; print $0} else { if ($1=="matching") {print $0} else {print word $0}} }' filename

答え3

必要に応じて実行awk

awk '/^Organism/{prefix=$2}/miR[0-9]{3}/{$0=prefix $0}1'

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