このようなファイルがあります。名前をfile1にしてください。
chr1 24018319 + a
chr1 24019249 + b
chr1 24020403 + c
chr1 24021281 + d
chr1 24022398 + e
chr1 45241272 + f
chr1 45241812 + g
chr1 45242446 + h
chr1 45243461 + I
chr1 45243801 + j
他の入力ファイルがあります。それらは次のとおりです。
chr1 24018319 0 +
chr1 24019249 22.4309 +
chr1 24020403 64.302 +
chr1 24021281 20.9355 +
chr1 24022398 32.8987 +
chr1 45241272 1.49539 +
chr1 45241812 318.519 +
chr1 45242446 207.86 +
chr1 45243461 112.155 +
chr1 45243801 67.2927 +
これらの他のファイルは、最初のファイルfile1と比較して行数が同じです。
各ファイルの3番目の列を最初のファイル1に追加したいと思います(行が同じであるため)。貼り付けコマンドを試しましたが機能しません。
私は次の出力が欲しい:
chr1 24018319 + a 0
chr1 24019249 + b 22.4309
chr1 24020403 + c 64.302
chr1 24021281 + d 20.9355
chr1 24022398 + e 32.8987
chr1 45241272 + f 1.49539
chr1 45241812 + g 318.519
chr1 45242446 + h 207.86
chr1 45243461 + I 112.155
chr1 45243801 + j 67.2927
私は何をすべきですか?私はこれを試しました
paste -d "\t" file $(cut -f 3 file2) $(cut -f 3 file3)
しかし、これはうまくいきません
ありがとう
答え1
次のコマンドは、例で要求された出力をある程度生成しますが、スペースは保持しません。
$ join -j 2 -o 1.1 1.2 1.3 1.4 2.3 file1 file2
chr1 24018319 + a 0
chr1 24019249 + b 22.4309
chr1 24020403 + c 64.302
chr1 24021281 + d 20.9355
chr1 24022398 + e 32.8987
chr1 45241272 + f 1.49539
chr1 45241812 + g 318.519
chr1 45242446 + h 207.86
chr1 45243461 + I 112.155
chr1 45243801 + j 67.2927
$