ライブUSBにファイルをコピーするとインストールが破損しますか？

私はライブUbuntuスティックを作成しましたが（重要な場合は永続性）、現在使用されているPCから起動できません（起動メニューが制限されています）。
Ubuntuのインストールを損なうことなくUSBにファイルを保存できます。それともLinuxブート以外の目的には使用できませんか？

次回Linuxを起動すると、このファイルはそのまま残り、Ubuntu内からアクセスできますか？