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awk は、重複する項目を含む、一致するすべての行を印刷します。

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awk は、重複する項目を含む、一致するすべての行を印刷します。

2つのファイル間に一致するすべての行（重複を含む）を印刷する方法

ソースファイル：

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22

クエリファイル：

SNP
RS1
RS2
RS2
RS3
RS4
RS4

希望の出力：

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

現在一致する行を検索するには、次のコマンドを使用していますが、重複項目は削除されますが、重複項目を含むすべての行を印刷する必要があります。

どんな提案でもお願いします

ありがとう

awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"}NR==FNR{a[$1]=$0;next}a[$1]{print}' queryfile sourcefile > output

答え1

このjoinコマンドはこれら2つのファイルを一緒にリンクします。

join sourcefile queryfile

出力（サンプルファイルから）

SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

答え2

本質的にファイルを逆順に処理する問題です。

$ awk 'BEGIN{FS=OFS="\t"} NR==FNR{a[$1]=$0;next} a[$1]{print a[$1]}' sourcefile queryfile
SNP value
RS1 0.55
RS2 0.52
RS2 0.52
RS3 0.25
RS4 0.22
RS4 0.22

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