私は4コアPCでGNU Octave 4.0.0を使用してモンテカルロシミュレーションを計算しています。シミュレーションでは、スクリプトを50,000回(私の問題に応じて)評価するのに約4時間かかります。これはコンピューティングに時間がかかります。計算時間を短縮するために、複数のコアで同時にOctaveを実行する方法があるかどうか疑問に思います。
よろしくお願いします。
答え1
GNU Parallelはマルチスレッドを実行しませんが、〜する多重処理の場合、次のように十分です。
seq 50000 | parallel my_MC_sim --iteration {}
デフォルトでは、CPUコアごとに1つのプロセスがあり、2つの並列ジョブの出力が混在しないようにします。
この並列化をOctaveスクリプトに入れることもできます。バラよりhttps://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html#Shebang
GNU Parallelは、同じコンピュータまたはSSHを介してアクセスできる複数のコンピュータでタスクを並列に簡単に実行できる汎用の並列ハンドラです。多くの場合for
、ループを置き換えることができます。
4つのCPUで32の異なるジョブを実行する場合は、並列化する簡単な方法は、各CPUで8つのジョブを実行することです。
代わりに、GNU Parallel はタスクが完了すると新しいプロセスを作成し、CPU をアクティブに保つことで時間を節約します。
インストールする
ディストリビューションにGNU Parallelがパッケージされていない場合は、rootアクセスなしでプライベートインストールを実行できます。これは10秒で完了できます。
(wget -O - pi.dk/3 || curl pi.dk/3/ || fetch -o - http://pi.dk/3) | bash
その他のインストールオプションについては、以下を参照してください。http://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/tree/README
詳細
より多くの例を見る:http://www.gnu.org/software/parallel/man.html
紹介ビデオを見る:https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1
このチュートリアルを見てください。http://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html
サポートを受けるには、メールリストに参加してください。https://lists.gnu.org/mailman/listinfo/parallel