リストの平均、標準偏差、標準誤差、値の数の決定

Question 1

StdevとSterrの計算は不明です。ただし、この方法では簡単に計算できます。

$ awk '{A[$1]++;B[$1]+=$2}END{print "Value\t\tAvg\tCount";for (i in A){print i"\t"B[i]/A[i]"\t"A[i]}}' input.txt
Value           Avg     Count
ACKR2/ADGRA2    9.01667 3
ACKR1/GPR107    10.22   1
ACKR1/XPR1      10.01   1
ACKR1/CMKLR1    10.41   1
ACKR1/CCRL2     12.66   1
ACKR1/GPR146    11.93   1
ACKR1/GPR137    10.73   1
ACKR1/CXCR4     13.01   1
ACKR2/ACKR3     11.1586 7
ACKR1/TPRA1     11.81   1
ACKR1/FZD5      10.72   1
ACKR1/TAPT1     11.24   1

awk '{
A[$1]++;B[$1]+=$2
}
END
{
print "Value\t\tAvg\tCount";
for (i in A)
{
print i"\t"B[i]/A[i]"\t"A[i]
}
}'  input.txt

Answer

StdevとSterrの計算は不明です。ただし、この方法では簡単に計算できます。

$ awk '{A[$1]++;B[$1]+=$2}END{print "Value\t\tAvg\tCount";for (i in A){print i"\t"B[i]/A[i]"\t"A[i]}}' input.txt
Value           Avg     Count
ACKR2/ADGRA2    9.01667 3
ACKR1/GPR107    10.22   1
ACKR1/XPR1      10.01   1
ACKR1/CMKLR1    10.41   1
ACKR1/CCRL2     12.66   1
ACKR1/GPR146    11.93   1
ACKR1/GPR137    10.73   1
ACKR1/CXCR4     13.01   1
ACKR2/ACKR3     11.1586 7
ACKR1/TPRA1     11.81   1
ACKR1/FZD5      10.72   1
ACKR1/TAPT1     11.24   1

awk '{
A[$1]++;B[$1]+=$2
}
END
{
print "Value\t\tAvg\tCount";
for (i in A)
{
print i"\t"B[i]/A[i]"\t"A[i]
}
}'  input.txt

Question 2

~~私は暇な時間がなく~~（明らかに）それを正しく学ぶつもりが全くないのでawk、Pythonでそれを把握できるかどうか調べるためにこの文を一緒に書いています。

@Kamarajから何も奪われませんawk（私はそれに投票しました）。

#!/usr/bin/env python3

colDict = {}  

with open ("cols") as infile: # Open the file
    for line in infile: # Read line by line
        splitLine = line.split() # Split line into list
        if splitLine[0] not in colDict: # Is value _not_ already in dict?
            value = splitLine[0] # Create new value
            colDict[value] = {} # Create nested dict
            colDict[value]["Avg"] = float(splitLine[1]) # Insert 'avg' 
            colDict[value]["Count"] = 1 # Insert count
        else: # Value _is_ in dict
            colDict[value]["Avg"] += float(splitLine[1]) # Add 'avg' float value
            colDict[value]["Count"] += 1 # Increment counter

print("Value\t\tAvg\tCount")
for value in sorted(colDict):
    print("{0}\t{1:.2f}\t{2}".format(value, 
                              colDict[value]["Avg"]/colDict[value]["Count"],
                              colDict[value]["Count"]))

実行後：

./parseCols.py
Value           Avg     Count
ACKR1/CCRL2     12.66   1   
ACKR1/CMKLR1    10.41   1   
ACKR1/CXCR4     13.01   1   
ACKR1/FZD5      10.72   1   
ACKR1/GPR107    10.22   1   
ACKR1/GPR137    10.73   1   
ACKR1/GPR146    11.93   1   
ACKR1/TAPT1     11.24   1   
ACKR1/TPRA1     11.81   1   
ACKR1/XPR1      10.01   1   
ACKR2/ACKR3     11.16   7   
ACKR2/ADGRA2    9.02    3

出力の唯一の違いは、出力がソートされ（）小数点以下の2桁にValue丸められることです。Avg

このようなコンパクトなソリューションを書いてくれた@Kamarajにもう一度感謝しますawk！

Answer