私のゲノムスキャンの結果である多くのファイル(3300)があります。anacovis2_1_summary_betai_reg.out ... anacovis2_3300_summary_betai_reg.out
各ファイルは次のようになります(最初の数行)。
1 4996 0.03907811 0.19369659 -10.43580084 0.00150707 0.00836902 0.06697258
1 4997 0.06213154 0.17373333 -10.98540609 0.00213014 0.00556877 0.15361369
1 4998 -0.00284978 0.19418451 -8.81547738 0.00016505 0.00741737 0.00777931
1 4999 -0.02047544 0.19574268 -9.12692867 -0.00059062 0.00632552 0.03357265
1 5000 -0.01769435 0.18560835 -13.15854481 -0.00038595 0.00540918 0.02543350
2 1 0.04259550 0.20256840 -10.98339784 0.00120126 0.00529516 0.08590396
2 2 -0.10782050 0.17555969 -9.13783036 -0.00355861 0.00689091 0.21784244
2 3 0.02548854 0.18571440 -15.42307129 0.00006131 0.00291038 0.00736142
2 4 0.03084782 0.17813247 -11.99911720 0.00109688 0.00630034 0.06459986
最初の列は1から26までの環境変数です。各ファイルを繰り返し、各環境変数の4番目の列のみを抽出し、環境変数番号がサフィックスで付けられたファイルに保存したいと思います。
各環境変数(たとえば、変数1)に対して個別にこれを行う方法を知っています。
awk '($1==1){print $4>FILENAME"_env1"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
または変数2の場合
awk '($1==2){print $4>FILENAME"_env2"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
しかし、この作業に時間がかかる場合は、ループでより速く実行できるかどうかを知りたいです。私はこれを試しました
for i in {1..26};
do awk '($1==i){print $4>FILENAME"_i"}'anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
done
しかし、それは役に立たない!誰でもこの問題を解決するのに役立ちますか?ありがとう
答え1
まさにここに。このようにしてのみ独自に機能しますawk
。
awk '{print $4>FILENAME"_env"$1}' anacovis2_{1..3300}_summary_betai_reg.out
すべて保存 環境すべてのファイルからenv1、env2などの同じファイルにドラッグアンドドロップFILENAME
します{print $4>"env"$1}
。