IDが一致したときに別のファイルの列をコピーする方法

データをマージ/結合するフィールドがソートされているとします。

$ join -1 4 -o1.1,1.2,1.3,0,2.2 file1 file2
1 115258827 12 HG00099 0|0
1 115258827 5 HG00100 0|1
1 115258827 8 HG00101 0|0
1 115258827 6 HG00103 0|0

これにより、4番目の列（ファイルの最初の列ではないためfile1指定）と1番目の列（ファイルをソートする必要がある列）の2つのファイルが結合されます。-1 4file2

この-oフラグは、join出力で見たいフィールドとそのフィールドをインポートするファイルを示します（1.3たとえば、「最初のファイルの3番目のフィールド」、0結合フィールドを意味します）。

使用の利点joinは、両方のファイルがメモリに完全に読み込まれる必要がないことです。

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ファイルがソートされていない場合は、次の方法を使用してファイルを一度に事前にソートできます。

sort -k4 -o file1 file1
sort     -o file2 file2

または、プロセス置換を理解するシェルを使用している場合は、次のように結合中にソートできます。

join -1 4 -o1.1,1.2,1.3,0,2.2 <( sort -k4 file1 ) <( sort file2 )

ソートされたデータは、join一度に各ファイルの数行だけメモリに保存できます。

努力する：

awk 'FNR==NR{seen[$1]=$2; next} seen[$NF]{print $0, seen[$NF]}' file2 file1

$1 列のキーを使用して、$2 列の対応する値を次の連想配列に格納します。ボンいつアッ読み取り専用ファイル2ここでNR==FNR、（読み取る入力ファイルが複数ある場合は、最初の入力ファイルに対して常にtrue）は、最初のNRレコード/行読み取りで1に設定されます。アッ単一の入力ファイルまたは複数のファイルのすべてのレコード/行を読み取るまでインクリメントし、FNR最初のレコード/行読み取りで1に設定されます。アッ現在の入力ファイルからすべてのレコード/行を読み取るまでインクリメントし、次のファイルで再び1にリセットされます。

最後の列の値が表示された配列の同じキー値と一致する場合、次のブロックは行全体を印刷します。ファイル1そして配列内の同じキーの値です。