
私はこの小さなスクリプトを持っています。my_script.sh
#!/bin/bash
size=$(infoseq -auto -nocolumns -delimiter ',' -only -noheading -length lambda_8.fa)
size=$(( $size - 200 ))
pos=$(($RANDOM % $size))
size2=$(( $pos + 200 ))
extractseq lambda_8.fa -regions $pos-$size2
私が望むのは、それを他のファイルと一緒に使用し、入力ファイルに基づいて他のファイルに出力を保存して、次のように使用できるようにすることです。
bash my_script.sh file.fa
出力は次のとおりです200_pb_file.fa
。