私のファイル形式は次のとおりです
first_filename_R1_001.fastq.gz
first_filename_R2_001.fastq.gz
second_filename_R1_001.fastq.gz
second_filename_R2_001.fastq.gz
etc
各グループのR1とR2のバージョンをスクリプトで一緒にペアリングしようとしています。しかし、サフィックスの削除に問題があります。
for i in /directory/*_R1_*;do
echo "$i"
j=${i%"$R1_001.fastq.gz"}"R2_001.fastq.gz"
echo "$j"
done
私が欲しいもの:
/directory/first_filename_R1_001.fastq.gz
/directory/first_filename_R2_001.fastq.gz
...
私が実際に得るものは次のとおりです。
/directory/first_filename_R1_001.fastq.gz
/directory/first_filename_R1_001R2_001.fastq.gz
...
何らかの理由で認識拡張子だけが削除されたようです。誰でも私を助けることができますか?