これはちょっと変ですね…Xが2台目のモニターからすべてのEDID情報を取得すること間違いなしですね。出力やログには何の問題もないようですからね。システムは出力イネーブルに正しく応答します。つまり、xrandrはすべての正しい情報を表示し、DVI接続出力を有効または無効にするとエラーを発生させず、Xinerama画面を作成するとマウスが左に飛ぶことがあります。
しかし、実際には2番目のモニター(DVI-VGAコンバーターに接続されている)に見えるのは黒い画面です。このトラブルシューティングをどのように開始できるかをご存知ですか? (winblowsではうまくいきます)...