アップグレードする必要があるzlibというプログラムがあります。以前にダウンロードしたことがないため、Ubuntuに付属しているかどうか疑われます。
通常はダウンロードしてコンパイルするだけですが、他のツール(vcftools)で使用されるため、ローカルにインストールすることはできません。どちらか一つが必要だと思います。
新しいバージョンのzlibをどこかにインストールし、システムに私がインストールしたフォルダにzlibを見つけるように指示します。 zlibが以前のバージョンと互換性がある場合は問題ありません。
現在のバージョンをアップグレードしてください(ただし、sudo apt-get installを実行すると最新バージョンがあることを示すメッセージが表示されます)。
どうすればいいですか?ありがとうございます。
答え1
私の考えでは、あなたが状況を少し混乱させているようです。zlib
Ubuntuシステムにローカルにインストールされた別のパッケージです。まず、Ubuntu / Debianリポジトリの1つに、zlib
Ubuntu / Debianおよびこれら2つのディストリビューションから派生した他のオペレーティングシステム用にインストールできる(事前に構築された)すべてのソフトウェアを含む最新バージョンがあることを確認します。
$ apt-get install zlib
しかし、そのコマンドを実行する前にパッケージが実際に呼び出されていることをもう一度確認してみましょうzlib
。
$ dpkg -l |grep zlib
ii zlib1g:amd64 1:1.2.7.dfsg-13 amd64 compression library - runtime
したがって、このパッケージは実際に更新されたようですzlib1g
。
$ apt-get install zlib1g
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
zlib1g is already the newest version.
0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 15 not upgraded.
したがって、その特定のバージョンを使用しているか、利用可能な最新バージョンはありません。
別の方法
最新バージョンのzlib
1.2.8を非常に簡単にダウンロードしてコンパイルし、一時的にLD_LIBRARY_PATH
これらのライブラリのコンパイル済みバージョンを指すことができます。これにより、システムにインストールせずに試すことができます。
一度設定したら、LD_LIBRARY_PATH
電話して試してVCFtools
みることができます。
次のステップ
次のオプションは、最新バージョンのzlib1gを含むサードパーティのリポジトリを検索するか、ソースパッケージをダウンロードしてそれを使用して独自の.debファイルを作成することです。独自のパッケージビルド環境を設定し、最初の.debファイルをビルドする方法についてのチュートリアルがたくさんあります。これは実際よりも複雑に聞こえます。
答え2
特定のバージョンのディストリビューションには、各プログラムの特定のバージョンが付属しています。出版がまさにそれだ。 (各ソフトウェアの次のバージョンにアップグレードするためにすべての時間を費やす「ローリングリリース」ディストリビューションがあります。より良いことがある場合は、リリースされたディストリビューションに固執してください。)
これzlib1gパッケージのバージョンUbuntu 12.04(精密)のバージョンは1.2.3.4で、Ubuntu 12.10(クォンタム)のバージョンは1.2.7です。 Ubuntu Webサイトからソースパッケージ(3つのファイルすべて:.dsc
、、、.diff.gz
または)をダウンロードしてから、そのバージョンを.orig.tar.gz
パッケージ.debian.tar.gz
にコンパイルできます。
sudo apt-get install build-essential fakeroot
sudo apt-get build-dep zlib
dpkg-source zlib_1.2.7.dfsg-13.dsc
cd zlib-1.2.7.dfsg
dpkg-buildpackage -rfakeroot -us -uc -b -nc
sudo apt-get install ../zlib1g-1.2.7.*.deb
最新バージョンのライブラリをインストールすると、非互換性が発生する可能性があります。 zlibを使用すると問題は発生しそうではありませんが、軽くする必要はありません。
または、ホームディレクトリのどこかに最新バージョンのライブラリをインストールし、必要な特定のプログラムにのみ使用してください。でzlibをコンパイルしてインストールした場合、~/lib/zlib1.2.8/lib
適切なラッパースクリプトは次のとおりです。
#!/bin/sh
export LD_LIBRARY_PATH=~/lib/zlib1.2.8/lib
exec vcftools "$@"