パッケージが正常にインストールされた後、チュートリアルでは/usr/local/binにリンクを作成するにはリンクを作成する必要があることがわかります。しかし：
ooker@ooker-Aspire-4741:~/gromacs-4.6.5/build$ sudo make links
make: *** No rule to make target `links'. Stop.
毎回開始する必要がありますが、source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC現在のシェルでのみ使用できます。別のシェルで実行するには再実行する必要があります。それ以外の場合は、パッケージがインストールされていないというメッセージが表示されます。
チュートリアルは次のとおりです。http://www.gromacs.org/Documentation/Installation_Instructions_4.5#Final_Installation
どうすればいいですか？
答え1
リンク作成を実行するときに正しいフォルダにありますか？文書が必要ですMakefile。書き込み権限がありますか/usr/local/bin？そうでない場合は試してくださいsudo make links。
リンクを手動で作成することもできます。
ln -s /usr/local/gromacs/bin/GMXRC /usr/local/bin/GMXRC
答え2
私は答えを見つけました。
使用
echo "source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC" >> ~/.bashrc
動作します。これはsource /usr/local/gromacs/bin/GMXRC~/.bashrc にコマンドを追加することを意味します。これにより、すべての新しいシェルが自動的にコマンドを実行します。