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UnixとAwkを使用して列に基づいてファイルを並べ替える

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UnixとAwkを使用して列に基づいてファイルを並べ替える

スコアの6番目の列に基づいて入力ファイルをソートする必要があります。

入力ファイル：

Sc2/80  20 . A T 86 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80  20 . A C 80 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60  55 . G T 90 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60  55 . G C 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20  39 . C T 97 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20  39 . C A 99 Pass N=2 F=5;U=4

予想出力：

Sc2/20 39 . C T 97 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/20 39 . C A 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60 55 . G T 90 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/60 55 . G C 99 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80 20 . A T 86 Pass N=2 F=5;U=4
Sc2/80 20 . A C 80 Pass N=2 F=5;U=4

ロジック：入力ファイル内の偶数行をすべて比較し、スコア（降順）で並べ替え、ファイル内の対応する奇数行を印刷します。ランダムな（偶数行）スコアが同じ場合、その奇数行のスコアを確認する必要があるため、より高いスコアが優先的に適用され、最初に印刷されます。

答え1

考えられる解決策の1つは、両方の行をまとめてソートしてから、リンクされた行を再分割することです。

awk '{ getline line; print $0, line }' input_file | 
    sort -k6,6nr -k15,15nr | 
    awk '{ $10 = "\n" $10; print }'

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