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awk を使用して新しい行を空白に置き換えます。
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awk を使用して新しい行を空白に置き換えます。

ディレクトリ内のすべてのファイルから生成されたテキストファイルがあります。このファイルを私が持っているスクリプトへの入力として使用したいが、正しく解析するには、特定の方法でフォーマットされたテキストファイルが必要です。 現在のテキストファイル(ファイル名リスト)の形式は次のとおりです。 A1_R1.fastq.gz A1_R2.fastq.gz A2_R1.fastq.gz A2_R2.fastq.gz A3_R1.fastq.gz A3_R2.fastq.gz RN各サンプルはタブで区切られ、同じ行になるようにペアになっている読み取り(同じ名前を持つが値...

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sed コマンドは、パターンに続く行の単語を置き換えるために使用されます。
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sed コマンドは、パターンに続く行の単語を置き換えるために使用されます。

私は、50,000を超える遺伝子ID行とその配列を含む次のファイルを作業しています。 gene_A:3342234 CTCTTTCTTTTACGCCT gene_A:1244-5205 CTCTTTCTTTTACGCCT gene_A:1838438 CTCTTTCTTTTACGCCT gene_B:1848584 CTCTTTCTTTTACGCCT gene_B:1029-4920 CTCTTTCTTTTACGCCT gene_C:3849029 CTCTTTCTTTTACGCCT これらのすべてに遺伝子IDがあり、その後にコロン、7〜9桁の参照番号、お...

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テキストファイル内の特定の列の文字列値を分割する方法
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テキストファイル内の特定の列の文字列値を分割する方法

Linuxシステムには2つの列を持つテキストファイルがあります。 1列= id_no(ほとんど5桁、一部は6桁)。 列2 = Genetic_markers(全長50674ビット)。 12345 0102010205 54322 2221110051 123456 1122011510 ファイルを次のように変更したいと思います。 12345 0 1 0 2 0 1 0 2 0 5 54322 2 2 2 1 1 1 0 0 5 1 123456 1 1 2 2 0 1 1 5 1 0 最初の列を数字に示すように右側に揃えるようにどのように変更で...

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マニュアルページに行番号を追加するには?
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マニュアルページに行番号を追加するには?

Linuxでページにman行番号を追加するには?infoマンページを閲覧するために行番号を使用したいと思います。マニュアルページをファイルに書き込んでVimで開くこともできますが、より良い方法はありますか? ...

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投稿を使って「プロジェクト」を検索してください。
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投稿を使って「プロジェクト」を検索してください。

だから私は以下の便利な小さな機能を持っています: zhelp() { man zshall | less -p "^ $1" } ...しかし、今「情報」に進む時間です。何かを検索するための簡単なオプションがあると思います...単なる文字列ではありません...しかし...申し訳ありませんが、わかりません...しかし、「アイテム」または「タイトル」または「アイテム」。前述のように、「man」には行の先頭の後に常に7つのスペースがあり、その後に「item」の名前が続きます。 「情報情報」を探しましたが、それを理解するには用語を既に知っておく必要があり...

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タブ区切りファイルの最初と5番目の列を検索して、5番目の列のスペースをタブに変換します。
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タブ区切りファイルの最初と5番目の列を検索して、5番目の列のスペースをタブに変換します。

タブで区切られた列を含むファイルがありますtsv。スペースで区切られた値を持つ5番目の列を取得したいと思います。区切りスペースをタブ区切りに変換し、新しいファイルとして保存します。 試み: cut -d"\t" -f"4" input.tsv awk -v OFS="\t" '$1=$1' input.tsv > output.tsv 入力する: Composite_Element_REF Gene_Symbol Chromosome Genomic_Coordinate TCGA-KL-8323-01A-21D-23...

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" "ノードが見つかりません。 infoコマンドを機能させるには、ダウンロードしたInfoドキュメントファイルをどのように追加しますか?
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" "ノードが見つかりません。 infoコマンドを機能させるには、ダウンロードしたInfoドキュメントファイルをどのように追加しますか?

info make同じものを開きますman make。私はmake.info.tar.gz以下からファイルをダウンロードしました。https://www.gnu.org/software/make/manual/、それから: sudo cp ~/Downloads/make.info.tar.gz /usr/share/info/ sudo install-info /usr/share/info/make.info.tar.gz /usr/share/info/dir 私の情報は(淫乱意図なし)から取得します。https://www.gnu.org/s...

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GRUB 2で「PC情報」ブートオプションを作成する
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GRUB 2で「PC情報」ブートオプションを作成する

GRUB i386-pc MBRの最新バージョンを実行している画像と同様の内容を表示するGRUBブートメニューから、「PC情報」ブートオプションをどのように生成できますか? カーネル(以前の6.5.8-arch1-1、現在は最新バージョン)を更新し、ホスト名とユーザー名を削除するために画像が少し編集されました。 編集:表示する必要があるのは、neofetchとuname -a(可能であれば色を含む)の出力を含む単純なファイルです。 ...

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異なる列の連続セルが同じ場合は、シェルスクリプトを使用して列の単語数を計算する方法!
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異なる列の連続セルが同じ場合は、シェルスクリプトを使用して列の単語数を計算する方法!

2列、3列、1列の連続セルが等しい場合、9列のC_R合計数を計算しようとします。S_Rファイルはベッド形式(タブ区切り形式)です。元のファイルは大きく、最初の列は染色体番号を定義します。ファイルの最初の数行は次のとおりです。 chr1 10200 10300 8 10000 10214 100 214 S_R chr1 10200 10300 8 10009 10233 100 224 S_R chr1 10200 10300 8 10014 10220 100 206 S_R c...

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線のある部分を別の部分にコピー
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線のある部分を別の部分にコピー

最初の部分をコピーしたいです(エクスソスカEVm****t1_、いいえ'.p[番号]')「>」で始まる行を入力し、同じ行の最後の「:」の前にaを貼り付けます。 入力する: >IxoscaEVm2293881t1.p1 type:complete len:255 gc:Universal :13-219(+) MFLRQLGAPRFYYARLFLRFIAVTIGPFLKSFPEKMLFLTYFPFYFWQRFSNINKRRKLLPATFLTLG >IxoscaEVm2798449t1.p1 type:partial5 len:345 gc:U...

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grep検索間の文字数の計算
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grep検索間の文字数の計算

grepコマンドを一連の他のコマンドと組み合わせて使用​​して一連の文字(fastaファイル内の「GAATTC」など)を見つけ、各一致の間に何文字があるかを計算する方法はありますか? ...

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コマンド実行中にコマンドの出力をどのように読み取ることができますか?
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コマンド実行中にコマンドの出力をどのように読み取ることができますか?

コマンドが停止するまでリアルタイムで更新されるプログレスバーを出力し、そのプログレスバーの割合を引き続き取得し、それをGUI(例:zenity)に表示したい場合はどうすればよいですか。 コマンドの最後でそれを取得して変数に保存する方法を知っています。これはこのサイトのほとんどの質問に出てくる質問ですが、コマンドの実行中にこれを実行したいと思います。 多くのゲームランチャーやアプリストアなど、すでに多くのアプリがこの機能をしているので可能なことだと思います。もう一度、どうやって同じことを続けることができますか? ...

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awk はタブ区切りファイルに列を追加しません。
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awk はタブ区切りファイルに列を追加しません。

次のコードを使用して、他の既存の列の計算に基づいて、タブ区切りのtxtファイルに2つの新しい列(15と16)を追加しています。 問題:新しい列データが端末に表示されますが、ファイルは列に更新されません。別のファイル()に送信すると列はcode ... > Sample.....2.txt存在しますが、区切り文字はタブから空白に変わります。 必須:タブ区切りファイルの既存の列計算に基づいて、コードの行に列15と16を追加します。 ファイル: Sample1_RVDB_sort_unique.txt パスワード: awk '{$15 = ($4/$13)*...

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